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水中存在的对人体必需的生物微量元素有14种，它们是Fe、Zn、Cu、I、Mn、Se、F、Mo、Co、Cr、Ni、V、Sn、Si。生物微量元素对人体的生理功能有：（a）促进酶的催化作用；（b）参与激素的分泌活动，如甲状腺，肾上腺分泌激素的活动；（c）是遗传物质核酸的构成部分；（d）参与新陈代谢，如参与人体内氧化还原系统的活动。
微量元素主要来自食物、饮水、空气和药物，所以在人体营养中生物微量元素比维生素更重要。微量元素并不是越多越好，成人每日所需各种元素都有一定的量，因此，饮水中的微量元素浓度都有一定标准。过量的微量元素对人体具有毒性，如饮用水中的微量元素硒、铬、氟、镍等就具有毒性。
1、硒硒的化合物对人和动物均有毒，在体内有积蓄作用，可引起急性中毒和慢性中毒，如食欲不振、四肢无力、头皮搔痒、癞皮、斑齿、毛发和指甲脱落。水质标准规定硒浓度＜0．01mg/L。
2、铬铬化合物对机体有全身致毒作用、刺激作用、变态反应、致癌和致突变作用。六价铬比三价铬毒性大。饮水中规定铬浓度＜0．05mg/L。
3、氟水中氟含量低时，发生龋齿病，含量高时导致斑齿症、氟骨症，甚至全身痪瘫。也有报道认为氟致癌。
4、镍致癌，欧共体规定饮水中镍浓度为0．005～0．05mg/L。
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